Levän puhdistaminen juomavedestä vaatii lähestymistavan, joka vastaa levän ominaisuuksia ja juomaveden koostumusta.
Käytännössä käytetään usein esivaihetta, jota seuraa sopiva suodatus- tai erotustekniikka levän tehokkaaksi poistamiseksi juomavedestä.
Hyvin valvomalla prosessia ja säätämällä sitä pitoisuuden ja virtaaman mukaan voidaan saavuttaa vakaa ja luotettava tulos.