Rensing av alger ut av kanalvann krever en tilnærming som tar hensyn til egenskapene til alger og sammensetningen av kanalvann.
I praksis brukes ofte et forbehandlingssteg, etterfulgt av en passende filtrerings- eller separasjonsteknikk for å fjerne alger effektivt fra kanalvann.
Ved å overvåke prosessen nøye og tilpasse den til konsentrasjonen og flowen, kan man oppnå et stabilt og pålitelig resultat.