Å rense alger ut av sjøvann krever en tilnærming som er tilpasset egenskapene til alger og sammensetningen av sjøvann.
I praksis brukes ofte et forstadium, etterfulgt av en passende filtrerings- eller separasjonsteknikk for å fjerne alger effektivt fra sjøvann.
Ved å overvåke prosessen nøye og tilpasse den til konsentrasjon og flow, kan man oppnå et stabilt og pålitelig resultat.