Filtrering av glykol ut av biodiesel krever en tilnærming som er tilpasset egenskapene til glykol og sammensetningen av biodiesel.
I praksis brukes ofte et forhåndstrinn, etterfulgt av en passende filtrerings- eller separasjonsteknikk for å fjerne glykol effektivt fra biodiesel.
Ved å overvåke prosessen nøye og tilpasse den til konsentrasjon og gjennomstrømning, kan man oppnå et stabilt og pålitelig resultat.