Fjerning av alge fra IJsselmeer-vann krever en tilnærming som tilpasses egenskapene til alge og sammensetningen av IJsselmeer-vann.
I praksis brukes ofte et forstadium, etterfulgt av en passende filtrerings- eller separasjonsteknikk for å fjerne alge effektivt fra IJsselmeer-vann.
Ved å overvåke prosessen nøye og tilpasse den til konsentrasjon og flow, kan man oppnå et stabilt og pålitelig resultat.